Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
ApobE9Q414 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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