Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx60E9PZQ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
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