Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm1330D3Z460 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm1330D3Z460 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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