Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms