Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CatipB9EKE5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms