Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms