Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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