Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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