Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D17h6s53eQ9Z1R4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms