Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx1Q9WV80 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx1Q9WV80 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms