Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms