Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms