Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0P4

Smap, Small acidic protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmapQ9R0P4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SmapQ9R0P4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SmapQ9R0P4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SmapQ9R0P4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SmapQ9R0P4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms