Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
VapbQ9QY76 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms