Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnip3Q9QXT8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Kcnip3Q9QXT8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Kcnip3Q9QXT8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Kcnip3Q9QXT8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Kcnip3Q9QXT8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Kcnip3Q9QXT8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Kcnip3Q9QXT8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Kcnip3Q9QXT8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnip3Q9QXT8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Kcnip3Q9QXT8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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