Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdkl2Q9QUK0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms