Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms