Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tlr5Q9JLF7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms