Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hip1rQ9JKY5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms