Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot9Q9JKY0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms