Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod2Q9JKK7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Tmod2Q9JKK7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Tmod2Q9JKK7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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Tmod2Q9JKK7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Tmod2Q9JKK7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Tmod2Q9JKK7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Tmod2Q9JKK7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Tmod2Q9JKK7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod2Q9JKK7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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