Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx6Q9JKK1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms