Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms