Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms