Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms