Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms