Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ropn1Q9ESG2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms