Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms