Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn2Q9ER65 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn2Q9ER65 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms