Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx12Q9ER00 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx12Q9ER00 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms