Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms