Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms