Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrotQ9DC50 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms