Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Cbx6Q9DBY5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cbx6Q9DBY5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms