Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fundc1Q9DB70 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms