Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfn3Q9DAD6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn3Q9DAD6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms