Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DA42 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DA42 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9DA42 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9DA42 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9DA42 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9DA42 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9DA42 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DA42 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DA42 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DA42 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms