Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D9D9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D9D9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D9D9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D9D9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D9D9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D9D9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D9D9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D9D9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D9D9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms