Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms