Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c6Q9D8P7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms