Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms