Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slx4ipQ9D7Y9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slx4ipQ9D7Y9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slx4ipQ9D7Y9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slx4ipQ9D7Y9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slx4ipQ9D7Y9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slx4ipQ9D7Y9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slx4ipQ9D7Y9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slx4ipQ9D7Y9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms