Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms