Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb4aQ9D6F9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4aQ9D6F9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms