Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms