Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ribc2Q9D4Q1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ribc2Q9D4Q1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms