Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms