Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms