Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim12aQ99PQ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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