Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms